A nível de fauna destacam-se o chapim-real, o chapim-carvoeiro, o chapim-de-poupa, a gaivota-ar-gêntea, o guincho, a negrinha e o pato-marinho, entre outros. Na Pateira de São Jacinto podemos observar vários exemplos de invernantes anatídeos como o pato-real, para além de garças como a garça-branca.
Na flora predominam choupos, salgueiros, juncos, líquenes, estorno e o pinheiro-bravo que fixa as terras desta reserva.
